Nejvyšší stupeň školské soustavy připravující vysoce kvalifikované odborníky pro jednotlivé vědní a umělecké obory i pro praxi; zahrnují funkci vzdělávací a vědecko-badatelskou.
Počátky vyššího školství v Českých Budějovicích jsou spjaty s příchodem piaristů, kteří zde ve 2. pol. 18. a v 1. pol. 19. století administrativně i pedagogicky zajišťovali chod několika vzdělávacích institucí včetně filozofického ústavu a biskupského semináře. Ačkoli se od pol. 19. století České Budějovice postupně proměnily ve významné nadregionální středisko vzdělanosti (v 1. pol. 20. století se řadily k městům s největším počtem středoškolských vzdělávacích ústavů v zemi), byla struktura školské sítě na území města stále neúplná; možnost vyššího vzdělání ve městě nabízel pouze biskupský seminář (do 1950).
Společensko-politické změny v letech 1945—1948 a politicky motivované rozhodnutí nastupující komunistické moci otevřely cestu k završení předválečného úsilí jihočeských představitelů o vybudování 1. vysoké školy v Českých Budějovicích i v jižních Čechách. Nejstarší vysokoškolskou institucí se stala pobočka Pedagogické fakulty Univerzity Karlovy v Praze, která v Českých Budějovicích zahájila činnost 1948. Od září 1960 začali v Českých Budějovicích studovat rovněž první posluchači Provozně ekonomické fakulty Vysoké školy zemědělské v Praze. Naděje vzbuzené Pražským jarem nastolily rovněž otázku zřízení samostatné vícefakultní univerzity v krajském městě, s jejímž otevřením se počítalo k 1. 10. 1969. Navrhovaná univerzita měla mít vedle fakulty pedagogické a zemědělské i fakultu lékařství a fakultu ekonomickou, ale následná normalizace tyto snahy o 20 let opozdila. Obě „historické“ českobudějovické fakulty se tak staly základem nově ustavené vícefakultní Jihočeské univerzity až 1991.
V roce 2003 udělilo ministerstvo školství akreditaci Vysoké škole evropských a regionálních studií, o. p. s., která od školního roku 2003—2004 poskytuje bakalářské vzdělání ve studijních programech Mezinárodní teritoriální studia (obor Regionální studia) a Bezpečnostně právní činnost (obor Bezpečnostně právní činnost ve veřejné správě), a nabízí i další vzdělávací programy pro úředníky veřejné správy (Management a marketing služeb). Kombinovanou i prezenční formu studia v těchto programech absolvují posluchači v areálu školy na Žižkově třídě v Českých Budějovicích (výukové prostory jsou umístěny v objektu kongregace petrinů) a od 2004 i na detašovaném pracovišti v Příbrami (v areálu Waldorfské školy; pouze kombinovaná forma oboru Regionální studia). Prvním rektorem školy byl 2003—2004 Emanuel Pecka (* 1932), 2004—2008 stál v čele školy Josef Dolista (* 1954), 2008—2012 Gabriel Švejda (*1944) a od 2012 Lubomír Pána (*1951).
V roce 2006 byla ve městě zřízena další vysokoškolská instituce – Vysoká škola technická a ekonomická se sídlem v Okružní ulici. Škola nabízí v prezenční i kombinované formě studia magisterský studijní obor Logistické technologie a bakalářské studijní obory Strojírenství, Technologie dopravy a přepravy, Konstrukce staveb, Stavební management a Ekonomika podniku. V roce 2014 otevřela Centrum technických studií v Táboře, kde bude probíhat výuka bakalářského studijního oboru Strojírenství se specializací Progresivní materiály. V letech 2006—2008 stál v čele školy Miroslav Krejča (*1956) a od 2009 Marek Vochozka (*1976).
AUTOR:
doc. PhDr. Miroslav Novotný CSc.
DVOŘÁK, Jiří. K dějinám jihočeského regionalismu In: Jihočeský sborník historický 1995. České Budějovice 1995, roč. 64, s. 140—150. ISBN 80-900155-6-5.
DVOŘÁK, Jiří. Vznik druhé vysoké školy v Českých Budějovicích (Provozně ekonomická fakulta VŠZ Praha), In: BARVÍKOVÁ, Hana, ed. Věda v Československu v letech 1953-1963: sborník z konference (Praha, 23.-24. listopadu 1999). Praha: Archiv Akademie věd České republiky v nakl. Arenga, 2000, s. 95-101. Práce z dějin vědy = Studies in the history of sciences and humanities, sv. 1. ISBN 80-86404-00-5.
JIROUŠEK, Bohumil. Českobudějovická pobočka University Karlovy a její zánik roku 1953. In: Věda v Československu v letech 1953—1963. Práce z dějin vědy, sv. 1. Praha.
NOVOTNÝ, Miroslav. Příprava učitelů v Českých Budějovicích a její proměny v letech 1945— 1963. In: BARVÍKOVÁ, Hana, ed. Věda v Československu v letech 1953-1963: sborník z konference (Praha, 23.-24. listopadu 1999). Praha: Archiv Akademie věd České republiky v nakl. Arenga, 2000. 591 s. Práce z dějin vědy = Studies in the history of sciences and humanities, sv. 1. ISBN 80-86404-00-5.
NOVOTNÝ, Miroslav. Českobudějovičtí vysokoškoláci a Pražské jaro. In: SVOBODNÝ, Petr, ed. a ZILYNSKÁ, Blanka, ed. Česká věda a Pražské jaro (1963-1970): sborník z konference, [Praha 22.-23.listopadu 2000]. Vyd. 1. Praha: Karolinum, 2001. 425 s. Práce z dějin vědy = Studies in the history of sciences and humanities, sv. 2. ISBN 80-246-0374-8.